Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMA6P60900 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMA6P60900 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMA6P60900 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMA6P60900 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms