Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms