Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
COPAP53621 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COPAP53621 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
COPAP53621 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPAP53621 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPAP53621 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms