Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms