Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DAP3P51398 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DAP3P51398 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DAP3P51398 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DAP3P51398 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DAP3P51398 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms