Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms