Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPAP49450 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPAP49450 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPAP49450 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPAP49450 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPAP49450 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPAP49450 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPAP49450 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPAP49450 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPAP49450 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPAP49450 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPAP49450 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPAP49450 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPAP49450 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPAP49450 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPAP49450 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPAP49450 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPAP49450 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPAP49450 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms