Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms