Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms