Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms