Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms