Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP6P35125 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP6P35125 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP6P35125 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP6P35125 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP6P35125 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP6P35125 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP6P35125 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP6P35125 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP6P35125 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP6P35125 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP6P35125 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP6P35125 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP6P35125 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP6P35125 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP6P35125 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP6P35125 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP6P35125 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP6P35125 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP6P35125 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP6P35125 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP6P35125 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP6P35125 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP6P35125 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP6P35125 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP6P35125 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP6P35125 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP6P35125 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP6P35125 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP6P35125 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP6P35125 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP6P35125 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP6P35125 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP6P35125 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP6P35125 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP6P35125 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP6P35125 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms