Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA5P31644 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms