Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms