Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA2P29317 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms