Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms