Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXP28300 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXP28300 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXP28300 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXP28300 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXP28300 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXP28300 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms