Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DNMT1P26358 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms