Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms