Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP1P23763 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP1P23763 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP1P23763 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP1P23763 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP1P23763 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP1P23763 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP1P23763 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP1P23763 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP1P23763 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP1P23763 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP1P23763 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP1P23763 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP1P23763 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP1P23763 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms