Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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