Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYF6P23409 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYF6P23409 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYF6P23409 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYF6P23409 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYF6P23409 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms