Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A1P11836 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms