Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA5P08648 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms