Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX7O95931 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX7O95931 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX7O95931 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms