Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVILO95425 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVILO95425 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SVILO95425 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVILO95425 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVILO95425 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVILO95425 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SVILO95425 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SVILO95425 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVILO95425 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVILO95425 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVILO95425 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SVILO95425 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms