Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNKO75909 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNKO75909 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNKO75909 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNKO75909 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNKO75909 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNKO75909 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNKO75909 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms