Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPLO60437 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPLO60437 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPLO60437 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPLO60437 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPLO60437 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPLO60437 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPLO60437 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPLO60437 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PPLO60437 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPLO60437 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PPLO60437 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPLO60437 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPLO60437 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPLO60437 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPLO60437 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPLO60437 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PPLO60437 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPLO60437 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPLO60437 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPLO60437 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPLO60437 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPLO60437 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPLO60437 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PPLO60437 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPLO60437 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPLO60437 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPLO60437 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPLO60437 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPLO60437 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPLO60437 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPLO60437 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PPLO60437 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PPLO60437 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPLO60437 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPLO60437 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPLO60437 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPLO60437 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PPLO60437 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPLO60437 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPLO60437 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPLO60437 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPLO60437 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPLO60437 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPLO60437 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPLO60437 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPLO60437 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPLO60437 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPLO60437 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPLO60437 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPLO60437 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPLO60437 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPLO60437 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PPLO60437 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPLO60437 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPLO60437 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPLO60437 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPLO60437 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPLO60437 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPLO60437 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPLO60437 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPLO60437 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms