Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms