Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms