Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLGNO14967 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLGNO14967 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLGNO14967 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLGNO14967 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLGNO14967 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLGNO14967 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLGNO14967 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLGNO14967 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLGNO14967 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLGNO14967 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLGNO14967 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLGNO14967 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLGNO14967 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CLGNO14967 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLGNO14967 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms