Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms