Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-2B6SEH9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms