Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms