Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC61Q9Y6R9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms