Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms