Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP24Q9UPU5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms