Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT7

FBXL3, F-box/LRR-repeat protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3Q9UKT7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL3Q9UKT7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms