Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF639Q9UID6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF639Q9UID6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms