Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MLH3Q9UHC1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms