Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRP2BPQ9P2M1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms