Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms