Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms