Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms