Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP7BPQ9NSQ0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP7BPQ9NSQ0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms