Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms