Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms