Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms