Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms