Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms